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植物种质资源,基因组学与生物信息学研究组
研究成果

植物叶绿体基因组提取以及山茶属叶绿体基因组测序研究中取得重要进展

文章来源:  |  发布时间:2013-07-07  |  作者:  |  浏览次数:  |  【打印】 【关闭

 

植物叶绿体基因组在进化研究中具有重要作用。其基因组大小在150 Kbp左右,编码约130个基因。传统的叶绿体基因组测序方法是通过设计覆盖全基因组的引物序列(至少100对引物)对其进行分段扩增,或者利用蔗糖密度梯度离心法从植物叶片细胞中分离提纯完整的叶绿体,并通过裂解叶绿体提取出完整的叶绿体DNA. 其中引物扩增法费时费力,测序花费较高。而蔗糖密度梯度离心法技术难度较大,实验过程需要超速离心机(数十万转数以上),且DNA提取效率较低。高立志研究组成员施超,胡娜,黄荟等通过多年的摸索,在蔗糖密度梯度离心法的基础上改进了一套高效的叶绿体DNA提取方法。实验表明该方法能够高效地从被子植物多个类群中提取出较为优质的叶绿体DNA, 提取后的DNA利用高通量基因组测序方法进行测序,将能够作为一种广泛使用的植物叶绿体DNA提取方法。该成果已经发表在PLoS ONE。 (Shi C, Hu N, Huang H, Gao J, Zhao Y-J, et al. (2012) An Improved Chloroplast DNA Extraction Procedure for Whole Plastid Genome Sequencing. PLoS ONE 7(2): e31468. doi:10.1371. )

 采用本方法提纯的三种植物的叶绿体DNA的HindIII 酶切图谱

 

  通过改良的高盐叶绿体DNA提取方法流程图


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