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植物种质资源,基因组学与生物信息学研究组
研究成果

山茶属植物基因组大小变异研究

文章来源:  |  发布时间:2013-07-07  |  作者:  |  浏览次数:  |  【打印】 【关闭

 

山茶属是山茶科中一个包含许多经济植物的重要类群。由于频繁的种间杂交和多倍化导致了该属的物种鉴定十分困难。细胞核DNA含量常常被用来衡量和计算植物基因组大小及倍性,该信息能够为我们了解植物进化和基因组变异提供许多重要信息。本研究组成员通过流式细胞技术旨在获得山茶属不同代表组部分物种的核DNA含量、基因组大小和倍性,并探究山茶属代表物种间系统关系以及山茶属核DNA含量的进化方向。我们对山茶属两个亚属(茶亚属和山茶亚属)中共139个个体进行了核DNA含量测定。实验结果表明改良版的WPB细胞裂解液非常适合茶树叶肉细胞分离,它能够明显减弱茶叶片中次生代谢产物对PI染色的影响,从而获得变异系数(CV)< 5%的可靠结果。采用不同的组织部位(花,花苞,叶)对实验结果影响不明显。通过实验获得云南大叶茶的基因组大小约为1C = 3.01 pg,即2940 Mb。山茶属中基因组大小变异存在既存在于种内也存在于种间,并且后者变异大于前者。由于频繁的多倍化导致细胞核DNA含量在整个山茶属基因组进化中呈现增加的变化趋势。该结果发表在国际学术刊物 PLoS ONE(Hui Huang, Yan Tong, Qun-jie Zhang, Gao L. Z.*. 2013. Genome size variation among and within Camellia species by using flow cytometric analysis and high-throughout genome sequencing. PLoS ONE8(5): e64981. doi:10.1371/journal.pone.0064981)。

 云南大叶茶(C. sinensis var. assamica)和玉米的荧光强度图

 

 山茶属成员间DNA含量及其系统发育关系


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