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植物种质资源,基因组学与生物信息学研究组
研究成果

云南山茶叶绿体微卫星的筛选及应用

文章来源:  |  发布时间:2013-07-07  |  作者:  |  浏览次数:  |  【打印】 【关闭

 

云南山茶是世界著名的观赏植物。其果可榨油,是著名的经济树种,仅分布于中国西南部。本研究利用大理茶 (C. taliensis) 叶绿体全基因组信息设计开发了32个叶绿体微卫星标记,选取了4个云南山茶野生群体的96个个体进行了多态性验证,发现有十对引物具有多态性。等位基因数2到4,Shannon指数平均值、Nei基因多样性、总遗传多样性、种群内遗传多样性、遗传分化系数和基因流指数分别为0.408、0.225、0.217、0.102、0.530和0.443。研究结果显示在云南山茶群体中呈现高的遗传分化和有限的基因流,可能是由于人类活动对云南山茶自然居群的干扰和破坏,使得其生境破碎化。云南山茶中cpSSR标记的确定为今后云南山茶的群体遗传、保护生物学和谱系地理学的相关研究提供了基础。该成果发表于Biochemical Systematics and Ecology, “Characterization of chloroplast microsatellite loci from whole chloroplast genome of Camellia taliensis and their utilization for evaluating genetic diversity of Camellia reticulata (Theaceae).”。


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