1. 在比较基因组学方面，利用新一代测序技术获得了竹亚科大量的基因序列，与禾本科其它已有全基因组序列的物种如水稻、玉米、小麦、大麦等进行了比较分析，发现了9 个与适应性选择相关的关键基因。鉴于竹亚科系统发育框架不完善，对功能基因的比较进化研究造成障碍，我们在广泛取样的基础上，首次基于高通量测序从质体全基因组和简化基因组（RAD）序列角度对其系统发育框架进行了构建，得到了较理想的结果，为深入开展功能基因的比较基因组学研究提供了必要基础。相关文章发表在PLoS ONE和Molecular Ecology Resources等期刊上。

2. 在功能基因组学方面，我们重点聚焦在竹亚科植物的独特开花和笋期高生长方面。从转录组和microRNA 组两个方面对开花基因和调控进行了探索，获得290 个开花功能相关基因的信息（该结果发表在期刊PLoS ONE上）和35 个新的与花发育相关microRNA 的信息（结果待发表）。我们还对竹子的成花转变时期进行了初步观测和鉴定，开发了成花转变时期的分子标记（结果待发表）。竹子笋期高生长方面的研究也取得了一些初步进展，相关结果发表在期刊植物分类与资源学报上。