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比较和功能基因组学研究组
研究方向

研究方向

文章来源:  |  发布时间:2013-07-08  |  作者:  |  浏览次数:  |  【打印】 【关闭

 

1. 在比较基因组学方面,利用新一代测序技术获得了竹亚科大量的基因序列,与禾本科其它已有全基因组序列的物种如水稻、玉米、小麦、大麦等进行了比较分析,发现了9 个与适应性选择相关的关键基因。鉴于竹亚科系统发育框架不完善,对功能基因的比较进化研究造成障碍,我们在广泛取样的基础上,首次基于高通量测序从质体全基因组和简化基因组(RAD)序列角度对其系统发育框架进行了构建,得到了较理想的结果,为深入开展功能基因的比较基因组学研究提供了必要基础。相关文章发表在PLoS ONE和Molecular Ecology Resources等期刊上。

2. 在功能基因组学方面,我们重点聚焦在竹亚科植物的独特开花和笋期高生长方面。从转录组和microRNA 组两个方面对开花基因和调控进行了探索,获得290 个开花功能相关基因的信息(该结果发表在期刊PLoS ONE上)和35 个新的与花发育相关microRNA 的信息(结果待发表)。我们还对竹子的成花转变时期进行了初步观测和鉴定,开发了成花转变时期的分子标记(结果待发表)。竹子笋期高生长方面的研究也取得了一些初步进展,相关结果发表在期刊植物分类与资源学报上。

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