1.植物物种多样性的起源与演化，特别是杂交物种形成

研究组主要以在横断山区多样性和特有性都高的类群开展研究。其中对菊科橐吾属为研究对象，与日本京都大学等建立了多年来的共同合作关系，并参与植物条形码橐吾属部分工作。目前，本研究与日本方面合作发表论文50余篇，研究组独立研究发表数篇文章，有发表于Journal of Biogeography的鹿蹄橐吾的谱系地理学研究，发表于Journal of Systematics and Evolution的棉毛橐吾的谱系地理学研究和东俄洛橐吾的谱系地理学研究，同域分布的棉毛橐吾和莲叶橐吾的自然杂交研究，等等。

以横断山区芹亚科植物为研究对象，对其系统分类的研究结果发表于Molecular Phylogenetics and Evolution，Taxon，Caryologia，Journal of Systematics and Evolution等刊物上。

2.遗传多样性的起源、演化与保护，特别是濒危物种遗传多样性和遗传结构的成因，以及与濒危的关系

研究组具长期的野外珍稀濒危保护植物的调查优势，并有多年的迁地保育经验。对相当部分的珍稀濒危保护植物，如：栌菊木、金铁锁、红河大翼橙、丁茜等，进行了遗传多样性和保护遗传学研究，研究结果发表于Annals of Botany，Conservation Genetics，Journal of Plant Research，Australian Journal of Botany,Genetic Resources and Crop Evolution等刊物上。本组对明星植物—苏铁属植物的研究开展的最为全面，从野外的全面调查、就地保护、迁地保护到遗传多样性和保护遗传学的研究。研究得到多项基金的支持，目前部分结果发表于Annals of Botany，Conservation Genetics等刊物上。

3.木兰科植物杂交育种与新品种选育

研究组以昆明植物园保存的木兰科植物的优势，进行人工杂交，选育新品种。目前，研究组已获得5项杂交育种专利；国家林业局申请含笑新品种5种（晚春含笑，云馨，云星，云霞，云瑞），云南省林业厅登记注册新品种6个（荷花含笑，郁金含笑，丹芯含笑，雏菊含笑，沁芳含笑，春月含笑）；木兰科植物的杂交育种研究获云南省科技进步三等奖。