王  群  博士，导师：李德铢研究员

学位论文题目：亮叶水青冈遗传多样性与长柄水青冈谱系地理学研究

学位论文摘要：

1、亮叶水青冈植物遗传多样性及遗传结构研究：

利用6个微卫星标记对中国特有种亮叶水青冈15个居群的遗传多样性及遗传结构进行了研究。结果表明，亮叶水青冈的遗传多样性水平非常高，居群间分化较弱。居群间存在广泛的基因交流，是导致风媒树种居群间分化较弱的原因。Mantel test 分析表明遗传距离与地理距离存在显著的正相关，这意味着随着地理距离的增加，基因流减弱从而导致遗传距离加大。根据遗传距离所做的UPGMA拓扑结构暗示采样居群呈东西分化的趋势。综合各项遗传多样性参数比较，浙江百山祖居群拥有最高的遗传多样性水平，其次是福建武夷山居群。

2、长柄水青冈谱系地理学研究：

利用2个叶绿体DNA非编码区序列分析了长柄水青冈20个居群134个个体，得到14个叶绿体单倍型。长柄水青冈的cpDNA单倍型多样性水平很高 (HT=0.945)，居群间存在很大的遗传分化(Gst=0.918, Nst=0.941)，并存在显著的谱系地理结构（U=3.05，P<0.01）。遗传多样性较高可能与进化历史有关，居群间遗传分化较高与低效的种子传播机制相关。由于H6及H9单倍型的地理分布跨度较大，不能排除长距离传播的可能性。单倍型谱系关系表明H3和H6为较古老的单倍型，其余单倍型皆是由这两个单倍型演化而来。嵌套分支分析表明长柄水青冈总体上表现为连续扩张模式，在局部地区存在有限基因流及邻域片段化效应。由于H3单倍型向西、向南及向东演化形成了5种单倍型，因此武陵山脉可能是长柄水青冈的散布通道。南岭、罗霄山脉一带具有丰富的单倍型，可能是长柄水青冈cpDNA单倍型多样化中心。在长柄水青冈进化历史上，可能存在至少两条迁移路线。第一条可能就是由武陵山脉向西、向南及向东扩张。第二条路线可能是从南岭、罗霄山脉一带向西、向南及向东扩张。第一条路线要早于第二条。浙江居群对华中及华南居群的形成没有贡献，可能是因为隔离造成的。四川盆地边缘居群可能是由华中贵州宽阔水居群演化形成。

曾春霞  博士，导师：李德铢研究员

学位论文题目：多DNA片段探讨温带竹子的系统发育和网状进化

学位论文摘要：

1、八个叶绿体非编码区片段的结果与分析：

对温带竹子支系18属68个种（含1变种），基于八个非编码区片段rps16-trnQ, trnT-trnL, rpoB-trnC, trnS-trnG, psaA-ORF170, trnD-trnT, atpH-atpI和rpl32-trnL的联合数据进行了最大简约法和贝叶斯分析，结果表明，虽然温带竹子支系作为单系继续得到强烈支持，但是由于叶绿体非编码区在温带竹子支系非常保守，分辨率较低，多位点、大片段的叶绿体基因组数据仍然不能解决温带竹子支系的深度系统重建问题。筱竹属复合群，青篱竹亚族和倭竹亚族均不是单系；箬竹属、赤竹属、短枝竹属为多系，铁竹属为单系，巴山木竹属、苦竹属、玉山竹属、箭竹属等11个属可能为并系或者多系。研究表明，取样范围和密度对于温带竹子支系的系统重建非常重要，高密度的取样显示以前可能得到支持的类群不是单系，不能轻易用某一个种或少数种来代表一个亚族、属或者组。

2、核核糖体rDNA ITS结果与分析：

对温带竹子支系的16属61个种的116个ITS序列进行了贝叶斯分析，结果发现ITS在温带竹子支系部分属种中来源于同一物种的克隆序列间存在较大的差异，表明ITS在这些物种中为不完全的一致性进化；不同属或者同属的不同种其进化模式和进化速率也不尽相同；根据GC含量、长度变异、碱基替代率和长枝吸引现象等方面证明Sasa shimidzuana_1为一个假基因；温带竹子支系为快速辐射分化的类群，物种间存在复杂的网状进化关系。由于ITS在多倍体和杂交物种中复杂的进化机制，因此ITS序列在温带竹子支系系统重建中需谨慎使用。

3、低拷贝核基因GBSSI结果与分析：

基于温带竹子支系的17属71种的408个序列进行了最大简约法和贝叶斯分析，结果表明，GBSSI基因在多倍体的温带竹子支系中为单拷贝；温带竹子支系为单系发生，筱竹属复合群，青篱竹亚族和倭竹亚族均不是单系，箬竹属、赤竹属、短枝竹属、巴山木竹属为多系，刚竹属、苦竹属、玉山竹属、箭竹属、筱竹属等为并系或者多系。据此，我们推测温带竹子支系内可能存在复杂的网状进化关系，其中17个种可能为异源四倍体起源，2种可能为异源六倍体起源；支持温带竹子支系的染色体基数为12。此外，对单拷贝核基因在多倍体基因组内的进化及其对系统重建的影响进行了初步讨论，并对温带竹子支系进一步深入研究进行了展望。

4、温带竹子支系与分子进化速率：

综合叶绿体八个非编码区片段、核核糖体rDNA ITS和GBSSI数据，温带竹子支系遗传分化较低，基因树枝长较短，分子进化速率较低。分析其原因可能主要有两个方面，一是竹子独特的生活史，世代交替时间通常为15-60年；二是与竹子的起源时间和快速辐射分化相关。可能正由于其生活史特别长，加之快速辐射分化、杂交、多倍化等等以及由此导致的DNA片段进化速率较低，使得温带竹子支系成为系统发育研究特别困难的类群。